1、核发单位不同
国家职业资格证书由中华人民共和国人力资源和社会保障部统一印制，证书的填写、编码、验印等按照人力资源和社会保障部有关规定执行。
职业技能等级证书则由经人力资源和社会保障部门公开遴选、备案的用人单位和社会培训评价组织（以下简称“评价机构”），按照统一的编码规则和参考样式要求，制作并颁发职业技能等级证书。
2、证书样式不同
国家职业资格证书的封面、内页均印有中华人民共和国国徽。其中，实行国家职业资格全国统一鉴定的职业，其证书在发证机关（印）处套印“人力资源和社会保障部职业技能鉴定中心职业技能鉴定专用章”，职业技能鉴定（指导）中心（印）处由省级职业技能鉴定（指导）中心用印。
根据《关于进一步规范职业技能等级证书样式及有关工作的通知》(人社鉴发〔2021〕1号）的相关规定：
职业技能等级证书由评价机构独立印制并发放，政府部门不参与监制。
证书内页按照《职业技能等级证书参考样式》进行印制，并加盖“评价机构名称”或“评价机构名称+职业技能等级认定专用章”印章。其中，评价机构印章在左侧，分支机构印章在右侧。
职业技能等级证书的封面则由各评价机构参照《职业技能等级证书参考样式》自行设计，具体要求如下：
①证书上不得使用“中华人民共和国”“中国”“中华”“国家”“全国”和“人力资源社会保障部门”“职业技能鉴定中心”“中国就业培训技术指导中心”以及“职业资格”“资格凭证”“就业凭证”“录用依据”等字样；
②不得出现国徽、政府部门徽标（logo）等标识，以及与上述相关或易产生歧义和误导的字样、图案或水印；
③不得出现本机构以外任何其他部门或单位的标识（logo）。
注：自2021年起，除了准入类国家职业资格证书外，其余证书均不允许印国徽！
3、收费标准不同
根据相关规定，国家职业资格证书的鉴定费用参照各省收费标准，职业技能等级认定的费用则由市场决定。
4、政策依据不同
国家职业资格证书是国家证书制度的一个组成部分，它通过国家法律、法令和行政条规的形式，以政府的力量来推行，由政府认定和授权机构来实施，在全国范围内通用的，对劳动者的从业资格进行认定的国家证书。
它是表明劳动者具有从事某一职业所必须具备的学识和技能的证明，是对劳动者具有和达到某一职业所要求的知识和技能标准，通过职业技能鉴定的凭证，是职业标准在社会劳动者身上的体现和定位。
而伴随着水平评价类退出国家职业资格目录，从事原有水平评价类的技能人才必须通过职业技能等级认定来获得证明自身能力的凭证。
相较于实行严格准入控制的国家职业资格证书，职业技能等级证书的认定更侧重于职业和工种本身，且赋予了用人单位、社会培训评价组织一定的自主权，对我国多元化技能人才评价体系的建立完善、技能人才队伍建设、技能强国建设等起着重要作用。
